Die neue Serie kann man ohne Probleme gucken, wenn man die alte nicht kennt. Ich kenne sie jedenfalls nicht und bin gut klar gekommen. Auch viele der Verweise und "Cameos" habe ich erkannt, obwohl ich von der alten Serie eigentlich gar nichts weiß.
In Staffel 2 gibt es sehr viele Folgen, die Torchwood vorbereiten. Man sollte also Torchwood erst danach gucken. Ich kenne allerdings bisher noch keine einzige Torchwood-Folge - noch. Nach meiner Einschätzung wird es wenige bis gar keine Überschneidungen zwischen den Serien geben. Sie laufen auch in Großbritannien meist nicht parallel.
Zu den Doctor Who-Specials: Diese gehören zwischen die Seasons und müssen unbedingt zu dem Zeitpunkt geguckt werden. Bei Season 2, 3 und 4 ist das davor spielende Weihnachtsspecial jeweils mit drauf. Die Specials-Box gehört zwischen Season 4 und 5. (siehe auch
http://de.wikipedia.org/wiki/Liste_der_Doctor-Who-Episoden#Neunter_Doktor)